行政院於 2004 年提出五年五百億元的「發展國際一流大學計畫」（現改為「邁向頂尖大學計畫」），希望五年內打造國內至少一所大學進入世界前一百大。2005 年 10 月 9 日教育部公布了該計畫的入圍名單，共有 12 所學校獲得補助，其中本校獲得每年 30 億的補助。
獲此經費挹注，責任自然也非常重大，本校「邁向頂尖大學計畫」的總體目標在提供一流師生學習與創新的優質環境，以培養我國未來跨領域優秀領導菁英人才，並提昇臺灣對世界的貢獻。未來將全面提昇教學研究、整合資源重點突破，追求卓越；準備在五年中發展出十到十五個領域成為世界一流，並以澳洲墨爾本大學為目標，在五年到十年中全校排名進入世界前一百大。期望本校師生員工能夠群策群力，攜手共進，克服種種困難，把本校推向世界百大，開創嶄新的未來，這樣才能向社會交代、向歷史交代。
校長
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